Ученые открыли и воскресили новый вид бактерии в Бурятии
Ученые обнаружили новый вид мезофильного нитчатого аноксигенного фототрофа — бактерии, которая проводит процесс фотосинтеза без выделения кислорода. Ее предложили назвать в «Candidatus Viridifilum namsaraevi» в честь Баира Бадмабазаровича Намсараева — учёного, много лет изучавшего микробиологию сибирских термальных источников.
Нашли ее еще в 2011 году, выделив из микробного сообщества «горячего» озера Умхей в Бурятии. Они изучили физиологию и морфологию живой монокультуры (штамм Um 2), определили маркерные последовательности ДНК и отправили их в GenBank.
В 2014 году живая культура погибла, но ее спасла метагеномика — секвенированные ранее маркерные фрагменты ДНК использовали как «отпечаток пальца» для поиска этого микроорганизма в природном сообществе озера Умхей.
Для восстановления генома бактерии использовали сборку из метагеномных данных. Из тысяч протяженных фрагментов ДНК биоинформатическими методами выделяются фрагменты, принадлежащие одному организму. Один из собранных образцов совпал с геномом утерянной культуры.
До сих пор полногеномные данные были доступны лишь для единичных представителей этой группы, хотя это один из древнейших фототрофов. Изучение филогенеза, метаболизма и морфологии данной группы фототрофов поможет понять ранние этапы развития фотосинтеза и энергетических систем клетки. Из-за уникальных ферментных систем и метаболических путей подобные организмы представляют большой интерес и для биотехнологии.
Эти бактерии участвуют в процессах, влияющих на баланс химических веществ в природе. Например, выступают барьером для распространения сероводорода в атмосферу. Изучение их роли в соленых и содовых водоемах, серных источниках поможет лучше понять функционирование этих экосистем.
