Мужская хромосома наконец-то расшифрована — для чего?

Более трех десятков лет длился крупнейший в истории биологии международный проект — «Геном человека». О его цели нетрудно догадаться из названия, и теперь она, кажется, достигнута. Недавно стало известно, что ученые расшифровали Y-хромосому, которая оказалась для них крепким орешком. Почему с ней возникли сложности и как полная последовательность генома поможет мужчинам?
Расшифровка генома человека началась еще в 1990 году. Научную команду возглавил Джеймс Уотсон, который в середине прошлого века был членом исследовательской группы, определившей структуру ДНК. Под его началом ученые по всему миру принялись секвенировать ДНК человека. Этот амбициозный проект был завершен в 2003 году. Вот только к тому времени геном расшифровали не целиком. Понадобилось еще 19 лет, чтобы в 2022 году наконец отчитаться о том, что уж теперь-то все. Хотя не совсем...
Одна хромосома — Y — не переставала вставлять палки в колеса и никак не поддавалась ученым. Дело в том, что во всех хромосомах человека довольно много повторяющихся фрагментов, а в мужской их больше половины от всей ее последовательности. Вот почему процесс сборки генома весьма непрост — попробуйте сложить головоломку, когда у нее большинство деталей одинаковые. Однако усовершенствованные методы секвенирования и последующего анализа (в том числе пригодилось машинное обучение) позволили преодолеть это препятствие. И вот на днях в журнале Nature опубликовали результаты кропотливой работы.
Полученная последовательность — более высокого качества, чем та, что входила в состав референсного генома, который еще называют эталонным. Это отдельный, собранный целиком геном. Он своего рода ориентир — как картинка на лицевой стороне коробки от пазла. Поскольку 99 % ДНК у разных людей совпадают, то эталон будут использовать для геномного анализа образцов любого человека.
Ученые собрали последовательность Y-хромосомы, состоящую более чем из 62 миллионов букв кода. Примерно половина из них раньше была неизвестна

Другой важный результат: полученные данные позволят раскрыть неизвестный ранее вклад отдельных генов в развитие и поддержание здоровья мужской репродуктивной системы. Болезни, связанные с фертильностью, например азоспермию, удастся изучить тщательнее и, возможно, разработать эффективную терапию для бесплодных пациентов. Также появится возможность выявлять мутации, связанные с ранее плохо изученными патологиями.
Помимо генов, связанных с мужским репродуктивным здоровьем и некоторыми наследственными заболеваниями, обновленная последовательность хромосомы позволит тщательнее изучить вклад расположенных в ней генов в работу разных систем организма. Ученые рассчитывают пролить свет на новые, ранее неизвестные гены и их функции.